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प्रोटीन फॉस्फोराइलेशन विविध सेलुलर कार्यों को नियंत्रित करता है और पौधों के प्रारंभिक विकास में महत्वपूर्ण भूमिका निभाता है।एराबिडोप्सिस अंकुरों में प्रोटीन फॉस्फोराइलेशन की पिछली जांच को पूरक और विस्तारित करने के लिए हमने एक वैकल्पिक दृष्टिकोण का उपयोग किया है जो रूबिस्को-क्षीण अर्क में बरकरार फॉस्फोप्रोटीन के स्थिर धातु-आयन आत्मीयता क्रोमैटोग्राफी (आईएमएसी) संवर्धन के साथ गैर-विकृतीकरण स्थितियों के तहत प्रोटीन निष्कर्षण को जोड़ता है, जिसके बाद पहचान की जाती है। द्वि-आयामी जेल वैद्युतकणसंचलन (2-डीई) और तरल क्रोमैटोग्राफी-टेंडेम मास स्पेक्ट्रोमेट्री (एलसी-एमएस/एमएस) का उपयोग करना।इन-जेल ट्रिप्सिन पाचन और चयनित जेल स्पॉट के विश्लेषण से 144 फॉस्फोराइलेटेड पेप्टाइड्स और अवशेषों की पहचान की गई, जिनमें से केवल 18 फॉस्फोपेप्टाइड्स और 8 फॉस्फोसाइट्स फॉस्फेट 4.0 और पी3डीबी अरेबिडोप्सिस थालियाना फॉस्फोराइलेशन साइट डेटाबेस में पाए गए।पहचाने गए 82 फॉस्फोप्रोटीन में से आधे से अधिक कार्बोहाइड्रेट चयापचय, प्रकाश संश्लेषण/श्वसन या ऑक्सीडेटिव तनाव प्रतिक्रिया तंत्र एसएमएस में शामिल थे।2-डीई और एलसी-एमएस/एमएस से पहले अक्षुण्ण फॉस्फोप्रोटीन का संवर्धन पेप्टाइड-स्तर संवर्धन का उपयोग करने वाले तरीकों की तुलना में फॉस्फोराइलेटेड थ्रेओनीन और टायरोसिन अवशेषों का पता लगाने में वृद्धि करता प्रतीत होता है, यह सुझाव देता है कि फॉस्फोराइलेशन साइट कवरेज के संदर्भ में दोनों दृष्टिकोण कुछ हद तक पूरक हैं।परिपक्व एराबिडोप्सिस पत्तियों के लिए पहले प्राप्त परिणामों के साथ युवा अंकुरों के परिणामों की तुलना करने पर पांच प्रोटीनों की पहचान की गई जो इन ऊतकों में अलग-अलग फॉस्फोराइलेट होते हैं, जो पौधे के विकास के दौरान प्रोटीन फॉस्फोराइलेशन की गतिशीलता की जांच के लिए इस तकनीक की क्षमता का प्रदर्शन करते हैं।