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एमिकासिन ग्राम-नकारात्मक सूक्ष्मजीवों (नीला-मवाद और गैस्ट्रिक बेसिली, खरगोश बुखार, सेराटिया, प्रोविडेंसिया, एंटरोबैक्टीरिया, प्रोटीस, साल्मोनेला, शिगेला) के साथ-साथ ग्राम-पॉजिटिव सूक्ष्मजीवों (स्टैफिलोकोसी, प्रतिरोधी सूक्ष्मजीवों सहित) के संबंध में अत्यधिक प्रभावी है। पेनिसिलिन और कुछ सेफलोस्पोरिन), और स्ट्रेप्टोकोकी के कुछ उपभेद।
इसका उपयोग गंभीर जीवाणु संक्रमण के लिए किया जाता है: पेरिटोनिटिस, सेप्सिस, मेनिनजाइटिस, ऑस्टियोमाइलाइटिस, एंडोकार्डिटिस, निमोनिया, फुफ्फुस एम्पाइमा, फुफ्फुसीय फोड़ा, शुद्ध त्वचा और नरम ऊतक संक्रमण, और मूत्र पथ के संक्रमण जो दवा के प्रति संवेदनशील सूक्ष्मजीवों के कारण होते हैं।