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CAPS बफ़र तैयार करने के लिए उपयोग किया जाता है, एक zwitterionic बफ़र pH 7.9-11.1 की सीमा में उपयोगी है।CAPS बफर का व्यापक रूप से पश्चिमी और इम्युनोब्लॉटिंग प्रयोगों के साथ-साथ प्रोटीन अनुक्रमण और पहचान में उपयोग किया जाता है।पीवीडीएफ (एससी-3723) या नाइट्रोसेल्यूलोज झिल्ली (एससी-3718, एससी-3724) में प्रोटीन के इलेक्ट्रो ट्रांसफर में उपयोग किया जाता है।इस बफ़र का उच्च pH इसे pI > 8.5 के साथ प्रोटीन के स्थानांतरण के लिए उपयोगी बनाता है।और एंजाइम या प्रोटीन के साथ न्यूनतम प्रतिक्रियाशीलता, न्यूनतम नमक प्रभाव।

केशिका क्षेत्र वैद्युतकणसंचलन में पृष्ठभूमि इलेक्ट्रोलाइट समाधान की सांद्रता बढ़ने पर आयन का वैद्युतकणसंचलन वेग कम हो जाता है।यह आयन (एमयूईपी) की इलेक्ट्रोफोरेटिक गतिशीलता में बदलाव के साथ-साथ इसे प्रभावित करने वाले शुद्ध बल, अर्थात् प्रभावी विद्युत क्षेत्र ताकत (ईईएफ) में बदलाव के कारण होता है।किसी आयन की इलेक्ट्रोफोरेटिक गतिशीलता इलेक्ट्रोलाइट समाधान की पूर्ण चिपचिपाहट में परिवर्तन और आयन के सॉल्वेटेड आकार में परिवर्तन के माध्यम से बदल जाती है।ईफ़ में परिवर्तन मुख्य रूप से चार्ज असममिति प्रभाव और इलेक्ट्रोफोरेटिक प्रभाव के परिमाण में परिवर्तन से होता है, जो दोनों आयनों की गति को धीमा कर देते हैं।इस अध्ययन में, ईफ़ पर पृष्ठभूमि इलेक्ट्रोलाइट एकाग्रता (0.02-0.08M 3-[साइक्लोहेक्सिलैमिनो]-1-प्रोपेनसल्फोनिक एसिड और काउंटर आयन (Li, Na, K, और Cs)) के प्रभाव का अध्ययन करने के लिए तीन-मार्कर तकनीक का उपयोग किया गया था। यह पाया गया कि बैकग्राउंड इलेक्ट्रोलाइट की सांद्रता स्पष्ट रूप से ईफ को प्रभावित करती है और जैसे ही बैकग्राउंड इलेक्ट्रोलाइट की सांद्रता शून्य के करीब पहुंचती है, ईफ ई के पास पहुंचता है। काउंटर आयन का ईफ पर मामूली प्रभाव पड़ा: जैसे-जैसे काउंटर आयन के हाइड्रेटेड त्रिज्या का आकार बढ़ता गया , ईफ़ कम हो गया। तीन-मार्कर तकनीक ऐसे निर्धारणों के लिए कुशल साबित हुई।