उत्पादों

हमने हाल ही में रिपोर्ट किया है कि पाइरेन न्यूक्लियोटाइड को अधिमानतः एक एबेसिक साइट, थाइमिन डिमर के 3'-टी और यीस्ट डीएनए पोलीमरेज़ एटा (पोल एटा) द्वारा सबसे अधिक क्षतिग्रस्त आधारों के सामने डाला जाता है।क्योंकि पाइरीन एक गैर-ध्रुवीय अणु है जिसमें कोई एच-बॉन्डिंग क्षमता नहीं है, डीपीएमपी सम्मिलन की असामान्य रूप से उच्च दक्षता इसकी बेहतर बेस स्टैकिंग क्षमता के कारण होती है, और पोल एटा द्वारा न्यूक्लियोटाइड के चयन में बेस स्टैकिंग के महत्व को रेखांकित करती है।पोल एटा द्वारा न्यूक्लियोटाइड्स के चयन में एच-बॉन्डिंग और बेस जोड़ी ज्यामिति की भूमिका की जांच करने के लिए, हमने बेस-संशोधित न्यूक्लियोटाइड्स 2,6-डायमिनोप्यूरिन, 2-एमिनोप्यूरिन, 6-क्लोरोप्यूरिन और इनोसिन की सम्मिलन क्षमता निर्धारित की, जो कि बेस जोड़ी ज्यामिति के आधार पर टेम्पलेट बेस के साथ अलग-अलग संख्या में एच-बॉन्ड बनाएं।वॉटसन-क्रिक बेस पेयरिंग सी और टी के विपरीत सम्मिलन के लिए न्यूक्लियोटाइड एनालॉग्स के चयन में एक महत्वपूर्ण भूमिका निभाती प्रतीत होती है, जैसा कि वॉटसन-क्रिक एच-बॉन्ड की संख्या में कमी और वृद्धि के साथ सापेक्ष सम्मिलन क्षमता में कमी से प्रमाणित है। दाता-दाता और स्वीकर्ता-स्वीकर्ता इंटरैक्शन की संख्या।न्यूक्लियोटाइड सम्मिलन की चयनात्मकता थाइमिन डिमर के 3'-टी की तुलना में 5'-टी के विपरीत अधिक है, पिछले काम के अनुसार सुझाव है कि 5'-टी को 3'-टी की तुलना में अधिक कठोरता से रखा जाता है।इसके अलावा, डिमर के दोनों टी के विपरीत ए का सम्मिलन वॉटसन-क्रिक बेस पेयरिंग द्वारा मध्यस्थ प्रतीत होता है, न कि हुगस्टीन बेस पेयरिंग द्वारा, जो ए और 7-डीज़ा-ए की लगभग समान प्रविष्टि क्षमताओं पर आधारित है, जिनमें से बाद वाले में एच का अभाव है। N7 पर संबंधन क्षमता।न्यूक्लियोटाइड्स के सम्मिलन के लिए सापेक्ष क्षमताएं जो वॉटसन-क्रिक आधार जोड़े बना सकती हैं, क्लेनो टुकड़े के समानांतर हैं, जबकि क्लेनो टुकड़ा अपनी अधिक आकार चयनात्मकता के अनुरूप बेमेल के खिलाफ अधिक दृढ़ता से भेदभाव करता है।ये परिणाम पोल एटा और क्लेन ओउ टुकड़े दोनों द्वारा न्यूक्लियोटाइड के चयन में एच-बॉन्डिंग और वॉटसन-क्रिक बेस जोड़ी ज्यामिति के महत्व को रेखांकित करते हैं, और इसके अधिक खुले और कम होने के कारण पोल एटा द्वारा सम्मिलन में आकार चयन की कम भूमिका प्रतिबंधित सक्रिय साइट.