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हेपेटाइटिस सी वायरस (एचसीवी), ऑटोइम्यून हेपेटाइटिस (एआईएच) और प्राथमिक पित्त सिरोसिस (पीबीसी) जैसे सिरोसिस यकृत रोगों में रोगजनक आणविक मार्ग खराब रूप से चिह्नित हैं।रोग रोगजनन में विभेदित रूप से व्यक्त जीन अक्सर महत्वपूर्ण होते हैं।दमन घटाव संकरण (एसएसएच) एक जीनोम-व्यापी दृष्टिकोण है जो विभेदित रूप से व्यक्त एमआरएनए प्रतिलेखों को समृद्ध करता है।हमारा लक्ष्य मात्रात्मक वास्तविक समय रिवर्स ट्रांसक्रिपटेस पोलीमरेज़ चेन रिएक्शन (आरटी-पीसीआर) के साथ संयुक्त एसएसएच का उपयोग करके सिरोसिस में विभेदक जीन अभिव्यक्ति का उपन्यास अवलोकन करना था।एचसीवी सिरोसिस, एआईएच सिरोसिस, पीबीसी और गैर-रोगग्रस्त लिवर ऊतक में लिवर ट्रांसक्रिप्टोम की जांच एसएसएच द्वारा की गई।परिणामी पूरक डीएनए (सीडीएनए) क्लोनों को डॉट-ब्लॉट संकरण द्वारा अंतर अभिव्यक्ति के लिए फिर से जांचा गया और फिर अनुक्रमित किया गया।चयनित जीन अभिव्यक्ति को वास्तविक समय आरटी-पीसीआर द्वारा निर्धारित किया गया था।एसएसएच के बाद, विभेदक जीन अभिव्यक्ति के लिए 694 क्लोनों की दोबारा जांच की गई, जिनमें से 145 को अनुक्रमित किया गया और पाया गया कि वे 89 विभिन्न जीनों से प्राप्त हुए हैं।सात क्लोन केवल व्यक्त अनुक्रम टैग (ईएसटी) अनुक्रम एन्कोडिंग जीन के साथ समरूप थे, जिनका कोई ज्ञात कार्य नहीं था।वास्तविक समय आरटी-पीसीआर द्वारा चार जीनों की अप-विनियमित अभिव्यक्ति की पुष्टि की गई: सिरोसिस के सभी रूपों में ट्रांसमेम्ब्रेन 4 सुपरफैमिली सदस्य 3 (टेट्रास्पैनिन सीओ-029), एआईएच सिरोसिस में हेजहोग इंटरैक्टिंग प्रोटीन (एचआईपी) और चिटिनेज 3-लाइक-1 (एचसी जीपी-39 या वाईकेएल-40) और एचसीवी सिरोसिस में आर्जिनिन-ग्लूटामिक एसिड रिपीट (आरईआरई)।जांचे गए सभी ऊतकों में आरईआरई जीन बहुरूपता और स्प्लिस वेरिएंट देखे गए।टेट्रास्पैनिन CO-029 अप-विनियमन मुख्य रूप से पित्त नलिका कोशिकाओं में स्थानीयकृत था।निष्कर्ष में, प्राथमिक खोज उपकरण के रूप में एसएसएच का उपयोग करके मानव सिरोसिस में विभेदक जीन अभिव्यक्ति का उपन्यास अवलोकन किया गया।विशेष रूप से, एचसीवी से संबंधित यकृत रोग में आरईआरई जीन और उसके उत्पादों के आगे के अध्ययन की आवश्यकता है।